MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021881	GAAG	2	8	661349	661356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021881	TGC	2	6	661409	661414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_021881	TACA	2	8	661443	661450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_021881	ATA	2	6	661490	661495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021881	CAATG	2	10	661547	661556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3506	NC_021881	GTA	2	6	661561	661566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021881	ATCTT	2	10	661579	661588	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3508	NC_021881	GAA	2	6	661592	661597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021881	AT	4	8	661610	661617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021881	CAT	2	6	661704	661709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021881	TGC	2	6	661733	661738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021881	AAGA	2	8	661787	661794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021881	TG	3	6	661830	661835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021881	TTA	2	6	661873	661878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021881	AT	3	6	661913	661918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021881	GCT	2	6	661924	661929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021881	ACA	2	6	662017	662022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_021881	CTCTT	2	10	662073	662082	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3519	NC_021881	AAAC	2	8	662098	662105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_021881	TAT	2	6	662122	662127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021881	T	6	6	662144	662149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021881	AT	3	6	662238	662243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021881	A	7	7	662353	662359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021881	CAA	2	6	662396	662401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021881	A	8	8	662480	662487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021881	T	6	6	662557	662562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021881	TTA	2	6	662565	662570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021881	TTG	2	6	662627	662632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021881	TGA	2	6	662672	662677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021881	CAG	2	6	662702	662707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021881	T	6	6	662769	662774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021881	TACA	2	8	662776	662783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_021881	AGT	2	6	662811	662816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021881	ATT	2	6	662873	662878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021881	TA	3	6	662910	662915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021881	AGC	2	6	662919	662924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021881	T	6	6	662926	662931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021881	CAA	2	6	662948	662953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021881	TTAT	2	8	662958	662965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021881	CTAT	2	8	662969	662976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_021881	GCT	2	6	663008	663013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021881	TG	3	6	663135	663140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021881	GCT	2	6	663149	663154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021881	ATTGG	2	10	663185	663194	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021881	AG	3	6	663202	663207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021881	T	6	6	663231	663236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021881	TTG	2	6	663881	663886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021881	ATT	2	6	663938	663943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021881	CT	3	6	663969	663974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_021881	T	6	6	663977	663982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021881	TAA	2	6	664093	664098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021881	GTT	2	6	664107	664112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021881	ATG	2	6	664177	664182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021881	TGT	2	6	664297	664302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021881	AG	3	6	664358	664363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021881	AT	3	6	664382	664387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021881	ATG	2	6	664422	664427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021881	GCA	2	6	664669	664674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021881	AAGC	2	8	664738	664745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_021881	GTA	2	6	664758	664763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021881	TTA	2	6	664930	664935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021881	TGC	2	6	664946	664951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_021881	AGA	2	6	664985	664990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021881	AAT	2	6	665022	665027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021881	GCA	2	6	665041	665046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021881	TA	3	6	665108	665113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021881	AT	3	6	665176	665181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021881	TCT	2	6	665192	665197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_021881	CAATG	2	10	665221	665230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3570	NC_021881	T	6	6	665517	665522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021881	T	7	7	665524	665530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021881	GTTA	2	8	665601	665608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021881	T	6	6	665624	665629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021881	CAT	2	6	665657	665662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_021881	ATA	2	6	666417	666422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_021881	T	6	6	666473	666478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_021881	AT	3	6	666984	666989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_021881	TA	3	6	667115	667120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021881	TTG	2	6	667137	667142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021881	ATT	2	6	667261	667266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021881	ACA	2	6	667269	667274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021881	TGA	2	6	667296	667301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_021881	TAG	2	6	667577	667582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3589	NC_021881	TA	3	6	667675	667680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_021881	TTA	2	6	667961	667966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021881	AGA	2	6	668093	668098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021881	TACAA	2	10	668135	668144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3598	NC_021881	TGC	2	6	668151	668156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_021881	GAAG	2	8	668433	668440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021881	TAG	2	6	668461	668466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3602	NC_021881	TCC	2	6	668507	668512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_021881	ACTG	2	8	668549	668556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_021881	CCA	2	6	668609	668614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_021881	AGC	2	6	668661	668666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021881	TTC	2	6	668676	668681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021881	AATAA	2	10	668682	668691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021881	T	6	6	668728	668733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021881	TAT	2	6	668739	668744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021881	T	6	6	668753	668758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021881	CTT	2	6	668795	668800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_021881	GAA	2	6	670463	670468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021881	TTA	2	6	670570	670575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021881	T	6	6	670583	670588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021881	GAG	2	6	670625	670630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3617	NC_021881	GT	3	6	670669	670674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021881	AG	3	6	670694	670699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021881	ATA	2	6	670700	670705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3622	NC_021881	GCA	2	6	670729	670734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021881	ATGT	2	8	670762	670769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021881	AAAT	2	8	670777	670784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021881	TA	3	6	670790	670795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021881	TTG	2	6	670819	670824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021881	A	8	8	670851	670858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021881	AGC	2	6	670959	670964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3630	NC_021881	AGT	2	6	671092	671097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021881	AGC	2	6	671114	671119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_021881	TCT	2	6	671133	671138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_021881	CA	3	6	671160	671165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_021881	AAC	2	6	671192	671197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_021881	AC	3	6	672250	672255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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